千葉道路公社の東金九十九里有料道路や九十九里有料道路はETCが利用できませんが、回数券を発売しています。
でも九十九里有料道路は、料金の徴収時間が午前6時から22時まで（夏場は午前5時から23時まで）ですし、将来の無料開放を見据えているのかもしれません。

神奈川県の三浦縦貫道路は、ETCカードは利用できませんが、回数券を発売しているほか、SuicaやPASMOなどの交通系電子マネーが利用できるとのことです。
交通系電子マネーが利用できるなんて意外でした。

ETCは導入コストが大きいと思われるので、道路公社としてもなかなか踏み切れないのだと思います。

三重県伊勢市の二見鳥羽道路にはETCがありませんでしたが、設置される事なく前倒しで無料開放されました。

茨城県日立市の日立有料道路は、常磐道日立中央IC直結のためETCが設置されています。
常磐道を下りる場合は一括徴収、乗る場合は有料道路の料金だけ先に精算されます。
同様に、ひたちなか市の常陸那珂有料道路は(東水戸道路を挟んで)北関東道の延長上にあるためETCが使えます。
こちらも北関東道側から通行すると一括徴収、反対行きでは一旦精算となります。

琵琶湖大橋にはもうすぐETCが導入されます。他の高速道路に接続しない、全く独立した有料道路のETC化は全国でもかなりレアなケースです。