副都心線新宿三丁目駅の「夢見るハート」がいいですね。
次点は千代田線乃木坂駅の「君の名は希望」でしょうか。

自分は副都心線東新宿駅2番線の「花咲く街角」、
丸ノ内線国会議事堂前駅B線の「東京旅姿」、
東西線の高田馬場駅A線の「A day the in metro (2)」が好みです。

銀座線の神田駅における「お祭りマンボ」の発車メロディアレンジ、
あとは昔初見で乗った時に衝撃を受けた南北線の発車メロディ(現在は埼玉高速・三田線)、
東西線の日本橋駅の「お江戸日本橋」、丸ノ内線の中野坂上駅A線「Endless Trip」辺りですね

個人的に好きなのは、有楽町線・副都心線小竹向原駅3番線（D線）の「キャロット」です。

↓視聴できます
https://www.amazon.co.jp/exec/obidos/ASIN/B00GGTGP9Y/hassya-22/

副都心線渋谷駅5番線の発車サイン音が好きです。
調べたら「愛ステーション」という曲名なんですね。

東西線A線側 門仲・木場・東陽町のメロディラインでしょうか。
時代劇の合間やCM前の「この後どうなるか？」みたいなBGMに最適だなぁと聞いています。
（水戸黄門や鬼平犯科帳のイメージです）
https://www.youtube.com/watch?v=EUxg6-Ch5wo

ランキング外の番外編としては、
日比谷線ホームにまで聞こえてくる、東西線B線側の茅場町発車メロディ
https://www.youtube.com/watch?v=bmCkn6G-aIo
（はじめは騒がしいなと思っていましたが、聞き慣れると茅場町らしく感じるようになりました 笑）

東西線九段下駅の「大きな玉ねぎの下で ～はるかなる想い」ですね～。
名曲です。

有楽町線地下鉄赤塚駅のB線「始まるよ」が好きです。
発車メロディとは、少し違いますが、無くなりつつある「営団ブザー」が、個人的に首位ですが、、