鉄道博物館にありますよ。東海道・山陽新幹線を走っていた0系もありますし、上越新幹線を走っていた200系もあります。

関東エリアで鉄道博物館以外ですと、青梅鉄道公園の0系先頭車しかないかと思います。
今でも走っている車両（形式）では、E2系の先頭車が宇都宮市内の企業敷地内に保存されています。

青梅鉄道公園の0系のほか、国分寺市のひかりプラザに、951形試験電車があります。1969年に製造され、1972年に時速286キロという当時の世界記録を出した車両です。車内は資料館になっています。
http://www.city.kokubunji.tokyo.jp/machi/midokoro/1002884.html