自治体主導で結節点を整備する動きはありますが、「直結」となると西山天王山以外は存じ上げないですね。京田辺のように「近い」はありますけれど…。

そうだ、都内のあまり知られていない高速バス停留所直結駅といえば、王子駅です。南口にバスターミナルがあり、東京~大阪線や空港リムジンなどが発着しています。
が、駅北側の通り沿いにあるJR高速バスのバス停のほうが、東北道方面へ向かうほとんどのバスが停車するなど本数が多く、南口バスターミナルは影が薄いです。

O-CAT(…難波から少々離れてしまっていますが)やT-CAT(こちらは水天宮前と繋がってます)など空港アクセス客のための高速バス停はいくつかあります。

至近ではなく直結となると確かに少ないですね。松井山手は北陸新幹線の延伸で駅ができることが決まったので、もしかすると真下に位置する高速京田辺が直結化するかもしれません。
鉄道もありえないほど混雑する時代になったので、大変興味深い質問に思いました。