本数を考えても、所要時間を考えても上野東京ラインですね。
ただ実際には最初に来る方に乗ると思います。

基本的には、所要時間が短い上野東京ラインを使うと思います。

やっぱり上野東京ラインを使うと思います。
上野、東京、品川での乗り降りは多いですが、湘南新宿ラインの池袋、新宿の乗り降りに比べれば、まだいいのかなと思います。もちろん時間帯にもよるのですが。

別の質問でも回答しましたが、東京総合車両センターにどんな車両が入場しているかを確認するのがクセになっているので、乗るのでしたら湘南新宿ラインです。

上野東京ラインを利用します。
尾久車両センターや田端運転所に留置されている車両を見たり、秋葉原～東京間の高架部を通るのも楽しみだからです。

時間の制約がない(所要時間差を気にしなくても良い)のなら、今なら湘南新宿ラインにします。
渋谷・原宿・新宿駅などの工事の進捗や赤羽線区間の景色など興味を引く車窓が多いです。
上野東京ラインも品川新駅、新橋駅改良、新幹線など見所は多いですが、最近見たばかりですので「今なら」という条件を付けました。