どちらかと言えば、一番後方の席ですね。窓側ならA席、E席のどちらでもいいですが。

吸わなくなってからタバコの臭いが苦手になってしまい、喫煙ルームから遠い車両（４〜６、９、12、13、16号車付近）を選んでいます。
　
東京からの遠方利用時は窓側で、名古屋〜京都間などの区間利用時はドタバタするのも失礼かなと思い通路側にしています。いずれにしてもB席だけは避けたいです。

自分も進行方向一番後ろのE席ですね。
リクライニングはそれほど倒さないけれど、やはり後ろに気を遣わなくても良いので。
同時に後ろから何かされる事も無いので。

前の席で何かやらかしそうな時であれば、視界に入っている分だけ気休めにはなりますし。

空いているのであれば、車両のなかほどにします。仕切扉の開閉も気になりませんので。
一番前や一番後ろだと、仕切扉の上にある案内表示器が見にくいということもあります。

前からリクライニングしてくる人がいませんので、いつも進行方向の一番前の席にするようにしています。駅に到着したときは、早く出れますし。

進行方向後ろ側にしています。
ただ、座席の後ろに大型スーツケースを置く人が多く、その場合は深くリクライニングできなくなってしまうのがつらいところです。

新大阪・博多方面に向かう下り列車苦い乗車する場合は、奇数号車なら後方座席、偶数号車なら前方座席にします。トイレやデッキのごみ箱が近いからです。

座席を選ぶときは、できるだけ空いている号車を選びます。そこから窓側席を選ぶのですが、やっぱり理想は一番後ろですね。
自動ドアの開閉がちょっと気になりますけれど、後ろの壁のコンセントも利用できますので重宝します。
各号車の座席指定状況を見てみると、車端部の席を選ぶ人が多いように感じます。

やっぱり、乗り心地がよいとされている、車両なかほどの場所でしょうか。もちろん窓側で。

進行方向一番前の座席にします。
目の前が壁ですけど、通路席でもコンセントがありますので。窓側席であればコンセントを2つ使うことができます。