隣の大鳥居駅は、環八通りと産業道路を跨ぐ踏切の解消が目的で地下化されましたが、穴守稲荷駅付近はそれほど交通渋滞がないことから地下化されなかったのだと思います。

確かに大鳥居駅から羽田空港国内線ターミナル駅まで地下になればいいような気がしますが、地下化工事は費用がかかるようですので、それなりの理由があるのだと思います。