「えきから時刻表」は駅時刻表と路線時刻表があり、列車番号も表示されて便利なんですけど、サービス終了は残念ですね。
JRの列車番号を調べたい場合は、JRのサイトで提供している時刻表を見ればいいのですが、民鉄の列車の列車番号を調べたい場合は「トレたび」の時刻表検索を使用するしかなさそうです。ただ「トレたび」では、「えきから」の路線時刻表のように通過列車を含む全列車を一覧で表示することができないようです。

なかなか、「えきから時刻表」に匹敵するサービスはなさそうですね。どこかの会社がシステムとデータを購入して、引き継いでくれればいいのですが…。