JR旅客営業規則の第147条に、次の文言があります。

同一旅客は、同一区間に対して有効な2枚以上の同種の乗車券類を所持する場合は、当該乗車については、その1枚のみを使用することができる。同一旅客が、同一区間に対し有効な2枚以上の指定券を所持する場合についてまた同じ。

いくら指定券を持っていても、1人で2席使用することはできません。

確か、JRの旅客営業規則では1人1枚しか使えなかったと思います。

空いている席は人が来ない場合は、車掌がその席の指定券を無効にして、指定券を持たないで乗った人に指定席料金を徴収して乗せることがあるそうです。