最初に確認しますが、採用枠の話ではなく質の話ですよね？

結論として、短期的に何がどうこうと言うことはないと思われます。

一般職の就職口として考えている就活生なら、志望先の変動はあるでしょうが、
専門職を希望している場合は当然ながらその会社あるいは業界が好きだから選んでいるわけですから、「JRが厳しいからJALにしよう」とはならないと思います。（両方好きという場合も無いとは言えませんが）
どちらかと言うとJRを諦めても同業他社が他業種に流れるのではないかと思います。

また、採用された優秀な人材が会社発展に寄与するのは、その後の教育・環境によって成長してから、となりますので最初の「短期的には」となるわけです。