以前西武新宿線をつかっていました。
西武新宿線は池袋線ほど急行と各駅停車の時間差がありません。（所沢～西武新宿間で急行36分、各駅停車46分）と、いうわけでわざわざ乗り換える人はそこまでいるわけではなく、各駅停車もそんなに空きません。

始発かよくて次の駅でいっぱいになり、運が良ければ乗り換える人の席にありつける、くらいです。
スカスカとはあまりにもほど遠いと思いますよ。

平日8時前後に田無を出発する電車の状況ですと、田無を出発した時点の各駅停車は座席はおおよそ埋まってますが、西武柳沢で某高校の生徒が降りるので西武柳沢では着席機会はあるかもしれません。

西武柳沢～武蔵関の利用者で高田馬場へ向かう人は朝だと準急を利用する人が多いので、各駅停車に乗りっぱなしの人は多くない印象です。

西武新宿線沿線には住んだことはありませんので混雑状況はわかりませんが、自分だったら上石神井駅利用者になるのがいいかなぁと思います。
始発の各駅停車が平日朝7時台に2本、8時台に3本ありますので、着席機会もあるかと思います。

通勤とは別ですが、上りの上石神井始発2番電車でも、高田馬場乗り換えで品川始発の「のぞみ99号」にも乗ることができますし、羽田空港にも6時台の前半に着くことができるので、早朝利用にも便利です。

あと、西武新宿線の下り最終が上石神井止まりだということもですね。

着席にこだわるなら、始発列車がある田無か上石神井ですかね。

ただ考えることは皆さん同じで、そうした駅は人気が高くなりがちで、家賃相場も当然高くなります。
その点も検討なさった方が良いと思います。

10分以上待って始発列車に狙って乗るよりも、すぐ来る準急や急行で立って乗った方がむしろ効率が良いかと思います。
※田無からは最速約30分、上石神井からは最速約20分

逆に帰りは、どの列車も一本待てば必ず座れます。
各停は運が良ければ直前に乗っても座れることがあります。