整理券を取り忘れた時は運転手に申告でいいと思います。
田舎の方だと整理券取り忘れたのを見て「お客様ー、整理券をお取りください」って言ってくれたり、どこから乗ったか覚えていてくれたりしますね。
循環バスでもないのに終点で料金表示をリセットしないで料金表がだいぶ埋まってきて整理券番号がエラいことになってたり（笑

整理券が要らないことも含め、ICカードでだいぶ楽になりましたね。

整理券を取り忘れた人が次のバス停で整理券取っているのを見たことがありますが、さすがにそれは不正乗車になるのでヤメましょう（笑

厳格に対応すると、始発からの運賃を請求されるみたいでしたが（テープのアナウンスで言ってたような）、
よほど怪しいと思われない限り、自己申告で通っていた様です（口頭で聞いて運賃を答えていたような）。
（10数年前の京成バスを利用していた頃の記憶より）

あまり距離の長くない、しかも混雑路線だったりすると、一人の乗客の運賃の差額に構ってられない、という面も有ろうかと思います。

会社や路線、運転手による差はあると思いますが、
日常茶飯事とは言わないまでも、珍しい事案ではないようですので、
まずは率直に「○○から乗りましたが、整理券を取り忘れました」と申し出るのが一番ですね。

≫よほど怪しい例
・地方などで、乗客が少なくて誰がどの辺りのバス停から乗ったか、なんとなく運転手が覚えてる
・挙動不審（笑）